MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 5922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017499	T	6	6	61	66	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017499	ATTC	2	8	90	97	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017499	ATT	2	6	110	115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017499	TAA	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017499	TGT	2	6	221	226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839643
6	NC_017499	ATGA	2	8	309	316	50 %	25 %	25 %	0 %	385839643
7	NC_017499	TTC	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839643
8	NC_017499	GAAA	2	8	369	376	75 %	0 %	25 %	0 %	385839643
9	NC_017499	AGA	2	6	421	426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839643
10	NC_017499	CAAA	2	8	430	437	75 %	0 %	0 %	25 %	385839643
11	NC_017499	ATA	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839643
12	NC_017499	ACA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839643
13	NC_017499	CAA	3	9	504	512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839643
14	NC_017499	ATT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839643
15	NC_017499	TAAC	2	8	628	635	50 %	25 %	0 %	25 %	385839643
16	NC_017499	GAA	2	6	645	650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839643
17	NC_017499	TGT	2	6	725	730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839643
18	NC_017499	ATT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839643
19	NC_017499	TAAA	2	8	969	976	75 %	25 %	0 %	0 %	385839643
20	NC_017499	A	6	6	974	979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017499	ACC	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017499	TAAT	2	8	1071	1078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017499	TTAA	2	8	1108	1115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017499	CAC	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017499	T	6	6	1138	1143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017499	CTAT	2	8	1158	1165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017499	ATT	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017499	T	7	7	1192	1198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017499	CAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017499	TG	3	6	1214	1219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017499	T	6	6	1231	1236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017499	GGAA	2	8	1239	1246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017499	CAA	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839644
34	NC_017499	AAAGA	2	10	1368	1377	80 %	0 %	20 %	0 %	385839644
35	NC_017499	TAA	2	6	1530	1535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839644
36	NC_017499	GTT	2	6	1538	1543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839644
37	NC_017499	AAC	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839644
38	NC_017499	AATC	2	8	1703	1710	50 %	25 %	0 %	25 %	385839644
39	NC_017499	AAT	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839644
40	NC_017499	ATT	3	9	1729	1737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
41	NC_017499	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	385839644
42	NC_017499	ATCT	2	8	1824	1831	25 %	50 %	0 %	25 %	385839644
43	NC_017499	ATT	2	6	1841	1846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
44	NC_017499	A	6	6	1970	1975	100 %	0 %	0 %	0 %	385839644
45	NC_017499	TTA	2	6	1976	1981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
46	NC_017499	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	385839644
47	NC_017499	AAG	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839644
48	NC_017499	GTT	2	6	2044	2049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839644
49	NC_017499	TTTA	2	8	2132	2139	25 %	75 %	0 %	0 %	385839644
50	NC_017499	TTAC	2	8	2143	2150	25 %	50 %	0 %	25 %	385839644
51	NC_017499	GAT	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839644
52	NC_017499	TAT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
53	NC_017499	A	7	7	2247	2253	100 %	0 %	0 %	0 %	385839644
54	NC_017499	TAA	2	6	2324	2329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017499	TAAT	2	8	2543	2550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017499	AAT	2	6	2621	2626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017499	CACT	2	8	2696	2703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017499	AAG	2	6	2727	2732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017499	TTGATC	2	12	2752	2763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017499	GTA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017499	ATC	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
62	NC_017499	GTT	2	6	2946	2951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839645
63	NC_017499	TAC	2	6	3018	3023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
64	NC_017499	ATTTG	2	10	3026	3035	20 %	60 %	20 %	0 %	385839645
65	NC_017499	TAA	2	6	3055	3060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839645
66	NC_017499	TGA	3	9	3086	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839645
67	NC_017499	AAGT	2	8	3138	3145	50 %	25 %	25 %	0 %	385839645
68	NC_017499	AAT	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839645
69	NC_017499	TAAA	2	8	3228	3235	75 %	25 %	0 %	0 %	385839645
70	NC_017499	TAGA	2	8	3250	3257	50 %	25 %	25 %	0 %	385839645
71	NC_017499	ATT	2	6	3304	3309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839645
72	NC_017499	TCA	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
73	NC_017499	ATC	3	9	3412	3420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
74	NC_017499	ATTT	2	8	3472	3479	25 %	75 %	0 %	0 %	385839645
75	NC_017499	ATG	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839645
76	NC_017499	ATTG	2	8	3544	3551	25 %	50 %	25 %	0 %	385839645
77	NC_017499	AG	3	6	3631	3636	50 %	0 %	50 %	0 %	385839645
78	NC_017499	A	7	7	3698	3704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017499	T	6	6	3705	3710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017499	ATA	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017499	TAA	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017499	TTTC	2	8	3850	3857	0 %	75 %	0 %	25 %	385839646
83	NC_017499	TAA	2	6	3870	3875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839646
84	NC_017499	T	7	7	3903	3909	0 %	100 %	0 %	0 %	385839646
85	NC_017499	GAAA	2	8	4016	4023	75 %	0 %	25 %	0 %	385839646
86	NC_017499	TGGT	2	8	4064	4071	0 %	50 %	50 %	0 %	385839646
87	NC_017499	AT	3	6	4093	4098	50 %	50 %	0 %	0 %	385839646
88	NC_017499	A	6	6	4106	4111	100 %	0 %	0 %	0 %	385839646
89	NC_017499	AATT	2	8	4164	4171	50 %	50 %	0 %	0 %	385839646
90	NC_017499	TGT	2	6	4188	4193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839646
91	NC_017499	A	6	6	4263	4268	100 %	0 %	0 %	0 %	385839646
92	NC_017499	ATA	2	6	4270	4275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839646
93	NC_017499	ATCA	2	8	4324	4331	50 %	25 %	0 %	25 %	385839646
94	NC_017499	GAA	2	6	4345	4350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839646
95	NC_017499	GAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839646
96	NC_017499	ACC	2	6	4399	4404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839646
97	NC_017499	TTG	2	6	4503	4508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839646
98	NC_017499	AAT	2	6	4593	4598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839646
99	NC_017499	CAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839646
100	NC_017499	AAT	2	6	4654	4659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017499	CTA	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017499	CTA	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017499	CTAAG	2	10	4739	4748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017499	TCT	2	6	4913	4918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017499	ATA	2	6	4932	4937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017499	GA	3	6	4941	4946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017499	TTC	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017499	TGA	2	6	4966	4971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017499	ATT	2	6	5011	5016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017499	GTT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017499	AAT	2	6	5056	5061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017499	ATT	2	6	5068	5073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017499	ATT	3	9	5095	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017499	TCC	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017499	TAA	2	6	5146	5151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017499	A	7	7	5150	5156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017499	ACA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017499	A	6	6	5186	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017499	AAG	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017499	TTA	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017499	TA	4	8	5317	5324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017499	AT	3	6	5331	5336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017499	TAAT	2	8	5349	5356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017499	AT	3	6	5370	5375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017499	TAA	2	6	5441	5446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017499	AGGT	2	8	5483	5490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017499	TAT	2	6	5509	5514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839647
128	NC_017499	ATAAAG	2	12	5665	5676	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385839647
129	NC_017499	ATC	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839647
130	NC_017499	AGA	2	6	5717	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839647
131	NC_017499	ATTGAA	2	12	5742	5753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385839647
132	NC_017499	GTAT	2	8	5791	5798	25 %	50 %	25 %	0 %	385839647
133	NC_017499	T	6	6	5804	5809	0 %	100 %	0 %	0 %	385839647
134	NC_017499	GAAA	2	8	5811	5818	75 %	0 %	25 %	0 %	385839647
135	NC_017499	TTC	2	6	5847	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839647
136	NC_017499	AAAG	2	8	5855	5862	75 %	0 %	25 %	0 %	385839647
137	NC_017499	CCA	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839647
138	NC_017499	ATT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839647
139	NC_017499	TTC	2	6	5968	5973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839647
140	NC_017499	CGTT	2	8	5985	5992	0 %	50 %	25 %	25 %	385839647
141	NC_017499	TTGA	2	8	6009	6016	25 %	50 %	25 %	0 %	385839647
142	NC_017499	TTG	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839647
143	NC_017499	AAG	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839647
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